Образование Бекман начал получать в городе Мидделбурге. Потом перебрался в Ледден, где вплотную занялся гуманитарным науками: литературой, богословием и философией. После обучения Исаак организовал изготовление свечей, самостоятельно основав завод. Ведение коммерческих дел оказалось не его стихией и в 1616 году Бекман продал свой бизнес. В 1618 году вплотную занялся медициной. В это же время он завел знакомство с Декартом. Они общались и обменивались мнениями насчет разных теорий до конца жизни Исаака.
До 1619 года Исаак работал профессором в Вене. Именно в это время он углубился в изучение работ известного ученого Филиппа Ван Ландсберга. С 1619 по 1620 года Бекман работал на аналогичной должности в Утрехте. В 1620 году ученый женился на Каталине де Серф. В браке у них родилось семеро детей.. Далее он в течение семи лет занимается преподавательской деятельность в Роттердаме. В этом городе он основывает колледж технических наук. Все результаты своих исследований Бекман записывал в отдельную рукопись, которая была опубликована его братом в 1644 году. Позже, в 1905 году, дневник был переработан. Последующие публикации были в 1939 — 1953 годах. Более никаких рукописных трудов Бекманом сделано не было.
Исаак Бекман отвергал подход Аристотеля к физике. Он был одним из первых, кто восстановил учение об атомизме. В этом отношении он был последователем Эпикура, древнего философа. Еще в 1613 году он изобрел принцип инерции. В 1626 году ученый выдвинул предположение, что работа любого насоса связана с атмосферным давлением. Это шло вразрез с учениями последователей Аристотеля.
Бекман умер 19 мая 1637 года.
Алексей Д